在光子嫩肤治疗中需要考虑和设置的参数有能量密度、脉冲数、子脉冲宽度和脉冲延迟时间。一般来说，子脉冲宽度越窄，治疗效果越好，但风险也会增加。延迟时间越长，治疗风险越小，但疗效也会受到影响。单一脉冲和双脉冲适用于色素性和血管性皮肤疾病的治疗，而双脉冲和三脉冲多应用于皮肤质地的改善和缩小毛孔等。治疗时对临床治疗终点的观察非常重要，合理的治疗是在强光照射10～20 min后，皮肤出现一定程度的红斑，但不是水肿性的，换言之，在治疗的时候找准皮肤的最小红斑量，此时的参数便是安全有效的参数。治疗皮肤血管性损伤时，有效的治疗后皮肤血管可能立刻消失，或者变黑，最多的情况是血管变得模糊不清并形成小的紫癜。

    不同的设备之间相差很大，如光谱范围及能量谱范围是不同的，而且波形及释放的方式也不同，因此，不同的设备治疗的能量设置可能有非常大的差异，很难推荐一种“金标准”式的设置。为了获得理想的治疗结果，可通过以下五种方式来调节治疗量：调节能量密度、调节脉冲宽度、调节脉冲延迟、调整脉冲数、更换滤光镜等。然而真正能调节以上五种参数的设备并不多。